Le big data au service de la médecine

Les nouvelles solutions de SAP pour la médecine personnalisée apportent une contribution importante à l'avenir du système de santé. Afin de garantir un fonctionnement optimal des nouvelles solutions, Dell développe actuellement une infrastructure parfaitement adaptée.

Contrairement à la médecine traditionnelle, l'approche personnalisée consiste à traiter les patients non seulement en fonction d'un simple diagnostic de maladie, mais aussi en tenant compte des conditions individuelles spécifiques - ce qui permet d'obtenir des résultats nettement plus rapides et meilleurs.

Le génome humain joue un rôle important à cet égard, car la prédisposition génétique individuelle a une grande influence sur l'apparition et le traitement correct d'un grand nombre de maladies graves - du diabète et des maladies cardiovasculaires à la maladie d'Alzheimer et au cancer. En outre, de nombreux médicaments déploient des effets différents en fonction des conditions génétiques.

Si le génome d'un patient est connu, il est donc possible de définir un traitement exactement adapté à cette personne. Les conditions sont aujourd'hui réunies.

Lorsque le premier génome humain a été séquencé il y a une dizaine d'années, il s'agissait encore d'une entreprise très coûteuse, avec des frais de plusieurs millions de dollars américains. Aujourd'hui, la technique a tellement progressé qu'il est possible de décrypter les génomes de patients individuels à un coût abordable.

Si les médecins souhaitent appliquer des thérapies personnalisées sur cette base, ils sont confrontés à des quantités de données gigantesques. Le génome d'un patient est composé d'environ trois milliards de paires de bases.

Il a besoin d'outils informatiques qui traitent ces informations pour lui et lui signalent les anomalies ou les changements importants. En outre, les génomes individuels doivent être comparés aux données de référence issues d'études et aux propres résultats cliniques si l'on veut déterminer le traitement idéal.

Données dans un système

Pour aider la médecine à relever ces défis, SAP a développé une ligne de produits entièrement nouvelle. Basée sur la plateforme de calcul en mémoire Hana, elle permet aux hôpitaux, aux entreprises pharmaceutiques et aux instituts de recherche d'obtenir de précieuses informations à partir de données volumineuses.

La solution SAP Foundation for Health en constitue la base. Elle a été conçue de manière à pouvoir utiliser et évaluer dans un seul système des données provenant de sources de recherche médicale, de dossiers médicaux électroniques et de séquences génétiques.

Pour ce faire, elle met à disposition un modèle d'entrepôt de données pour les informations cliniques, offre une gestion de l'intégration des données spécifique au secteur et prend en charge les analyses en temps réel de grandes quantités de données structurées et non structurées. La solution est donc particulièrement adaptée pour :

• l'analyse en temps réel dans la recherche et le développement, la génomique et d'autres sous-domaines de la biologie moderne, également appelés disciplines "-omiques" ;
• la constitution et l'analyse de groupes de patients, ainsi que l'affectation des patients aux essais ;
• Analyses en temps réel de grandes quantités de données structurées et non structurées (textes) ;
• des solutions avancées de collaboration dans le domaine de la santé.

Dans ce contexte, le logiciel fournit des résultats fiables et dignes de confiance, car il offre une transparence totale des données et les utilisateurs ont un contrôle total sur l'utilisation, le traitement et l'évaluation des données.

Sur la base de SAP Foundation for Health, SAP développe également des solutions avancées pour certains aspects de la médecine personnalisée. La première de ces solutions, SAP Medical Research Insights, est déjà prête. Sa mission est de permettre aux médecins de comparer rapidement, simplement et en toute sécurité les séquences génétiques de patients ou de groupes de patients.

SAP a développé cette solution en collaboration avec le Centre national des maladies tumorales (NCT) de Heidelberg, l'une des principales institutions dans les domaines des soins aux patients, de la recherche sur le cancer et du dépistage du cancer.

Grâce à SAP Medical Research Insights, le NCT a pu remplacer un système obsolète dans lequel le personnel médical devait effectuer des recherches dans d'innombrables bases de données, compiler des listes de patients, imprimer des dossiers de patients et vérifier manuellement si les patients répondaient aux critères des essais cliniques.

Cela nécessitait l'examen de chaque dossier, ce qui rendait la compilation et l'analyse des données des patients extrêmement compliquées et chronophages.

En revanche, SAP Medical Research Insights offre les possibilités suivantes :

• Les chercheurs cliniques peuvent filtrer et regrouper les patients selon de multiples attributs, identifier des candidats pour des essais cliniques selon des critères sélectionnés, effectuer des analyses de survie selon la méthode Kaplan-Meier et générer des estimations sur l'évolution ultérieure de la maladie ou de la guérison à partir de données en temps réel et les illustrer sous forme de graphiques ;
• Les spécialistes des départements de recherche et de développement des entreprises des sciences de la vie peuvent analyser rapidement les données génomiques, protéomiques et cliniques provenant de sources multiples, ce qui leur permet d'acquérir des connaissances médicales cruciales pour développer des médicaments, des appareils et des services en vue d'un meilleur traitement individuel ;
• les chercheurs cliniques et les spécialistes des départements de recherche et de développement peuvent créer des graphiques clairs des résultats afin d'identifier les tendances et les corrélations pour des groupes de patients spécifiques et d'améliorer l'analyse pour identifier des candidats pour des projets de recherche clinique.

SAP a déjà annoncé d'autres solutions spéciales basées sur SAP Foundation for Health. Il s'agit entre autres d'applications pour l'Internet des objets, afin de saisir et d'évaluer les données des appareils médicaux individuels, par exemple pour mesurer la glycémie des patients - et de permettre ainsi de surveiller en permanence l'état de santé des patients atteints de maladies chroniques.

Des bundles logiciels/matériels prédéfinis

Afin de garantir un fonctionnement optimal des nouvelles solutions, Dell travaille avec SAP et Intel à la mise en place d'une infrastructure parfaitement adaptée. Sur la base des produits Dell certifiés Hana, le Global SAP Center of Excellence de Dell crée actuellement une architecture de référence dont les composants sont sélectionnés de manière ciblée pour répondre aux exigences des solutions et sont adaptés les uns aux autres.

La vitesse est l'un des principaux défis à relever. Les processus et les cycles de traitement des données doivent être adaptés les uns aux autres de manière à exclure les périodes d'inactivité, c'est-à-dire les processus de fonctionnement à vide, à ce que les systèmes soient constamment utilisés et à ce qu'il n'y ait donc pas de retards inutiles.

C'est la seule façon de garantir que les énormes quantités de données médicales, par exemple celles d'un génome humain, puissent être traitées et analysées en temps réel. Cette architecture de référence supportera aussi bien la plateforme de base SAP Foundation for Health que la solution SAP Medical Research Insights qui s'appuie sur elle, ainsi que toutes les autres solutions à venir.

Pour ce faire, elle fournit des bundles logiciels/matériels préfabriqués, y compris des services complémentaires. Les établissements de santé, les organisations et les entreprises peuvent ainsi introduire rapidement les solutions et les exploiter de manière fiable. Enfin, l'architecture de référence met à leur disposition une infrastructure standardisée pour leur utilisation dans le monde entier.